¿En qué difieren los ateos religiosos que originalmente provenían de diferentes tradiciones religiosas?

El ateísmo es: –

la incredulidad o falta de creencia en la existencia de Dios o dioses

Dado que tanto el Islam como el hinduismo presentan una u otra noción de un Dios, múltiples dioses u otras deidades, entonces no se puede ser ateo y musulmán o hindú. En el Islam, un ateo es visto como un Kaafir, que traducido en términos generales significa ‘un velo de la verdad’:
Ateísmo y religión
Kuffir

sin embargo
Hay una ‘secta’ del hinduismo que de alguna manera acomoda el ateísmo. El hinduismo es visto como una forma de vida en lugar de religión, para algunos. Tiene muchas corrientes y hay una corriente de pensamiento ateo dentro del hinduismo:
El ateísmo en el hinduismo

Actualizar:
Parece que lo que realmente quisiste decir es ¿en qué se diferencian los ateos, que anteriormente eran musulmanes o hindúes?

Bueno, creo que culturalmente hablando, en ambos casos, ser ateo es menospreciado. El censo de la India de 2011, sorprendentemente, ni siquiera mencionó el ateísmo como una opción:
Irreligion en India
Los ateos indios buscan reconocimiento en la tierra de un millón de dioses – The Times of India

Salman Rushdie: un ateo de origen musulmán liberal

En todo el mundo y especialmente en el Medio Oriente, los musulmanes que luego se declaran ateos se encuentran con una fuerte resistencia. Arabia Saudita va aún más lejos al declarar que el ateísmo es un crimen y los compara con los terroristas:
Arabia Saudita declara que todos los ateos son terroristas en una nueva ley para tomar medidas enérgicas contra los disidentes políticos
Supongo que esto significa que, en Arabia Saudita, ¡el ateísmo se castiga con la muerte !

Nada puede ser significativamente generalizado, incluso sobre uno solo de estos grupos.

El subconjunto de ateos que solían ser musulmanes es amplio y generalizar mucho sobre ellos es una falacia de asociación.

Son potencialmente tan parecidos o diferentes como cualquier otro individuo.

Lo único que se puede decir con certeza es que todos los ateos tienen una falta similar de creencia en una o más deidades.

Nunca he sido creyente, así que no tengo experiencia personal aquí.

Pero he escuchado de ateos que vienen de diferentes orígenes. Un ex cristiano, por ejemplo, puede tener dificultades para superar el infierno. Incluso 20 años después, todavía tienen miedo, miedo que les fue inculcado cuando eran niños pequeños.

Esto es abuso infantil.

Un ex musulmán puede tener problemas para adaptarse de otras maneras. La igualdad de género puede ser una.

La igualdad de género existe en muchas culturas cristianas, pero es mucho más desigual en los países musulmanes.

Lamentablemente, superar las doctrinas puede ser difícil. Mi corazón está con ellos, lo que otros les hicieron es imperdonable.