No es una cuestión ética, ya que la ética tiene que ver con afectar a otros seres (generalmente personas). Para un planeta deshabitado, no existen tales seres; suponiendo que te refieres a un planeta sin vida de ningún tipo.
Es bastante difícil imaginar un sistema ético que requiera que los gases de un gigante gaseoso se dejen intactos, que las montañas en un planeta árido rico en minerales tengan un “derecho” a su forma, que un océano de agua sin vida no pueda ser atraído.
Puede encontrar una pregunta interesante si reflexiona sobre la responsabilidad ética de sembrar estos planetas con vida, y luego dejar los recursos intactos para esa vida. Pero lo que estás preguntando aquí se determinó hace mucho tiempo, cuando los humanos abandonaron África por primera vez: ¿es ético que continúen su forma de vida en una nueva tierra?
Mientras la vida allí no se vea irreparablemente dañada, hemos elegido que sí, podemos colonizar nuevas ubicaciones.
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Cortar un árbol está bien. Todos ellos no están bien. Tomar los minerales que necesita de una montaña está bien, en forma de minería. Eliminar una montaña entera y dejar los escombros no deseados esparcidos por un paisaje existente no está bien. Pero ambos son porque eso destruye un ecosistema existente. No veo que esto sea un problema para la minería de asteroides o la minería a cielo abierto en Marte.