No, si no fuera por otra razón que había judíos fuera del imperio bizantino.
Todos perseguían a los judíos en algún momento de la Edad Media y más allá. Hubo persecuciones periódicas en el imperio bizantino, en países musulmanes y en las naciones católicas del oeste. Incluso hubo, iirc, persecuciones de judíos en China como resultado de supresiones generales de religiones extranjeras. Y sin embargo, los judíos sobrevivieron. ¿Por qué? Bueno, la mayoría de esas persecuciones no fueron 100% efectivas. A menudo tenían excepciones y lagunas, lo que permitía que algunos judíos permanecieran. Sin embargo, lo que es más importante, no sucedieron todos al mismo tiempo, y siempre hubo judíos en otros lugares. Los judíos perseguidos en un país podían elegir huir y unirse a las comunidades judías en otro, y siempre había otros países. En el caso improbable de que el judaísmo fuera aniquilado en el imperio bizantino y el Islam no existiera, todavía habría judíos al lado en Persia o en otros países del oeste. Al menos algunos judíos bizantinos podrían unirse a ellos. Y dado que, como Daniel Vianna señala correctamente, la existencia de judíos era un accesorio útil para los cristianos, la persecución del momento finalmente terminaría y los judíos eventualmente volverían a filtrarse en el imperio.