Los otomanos eran en gran parte musulmanes, específicamente de la denominación sunita. Se les dio el título de Califa del Islam después de su conquista de los mamelucos en el siglo XVI y, por lo tanto, eran la autoridad suprema del Islam sunita. Las tierras que controlaban eran mayoritariamente musulmanas, con solo unos pocos Elayats (regiones administrativas) cristianas en la península de los Balcanes. Ocupaban el centro de la Iglesia Ortodoxa Griega, Constantinopla, así como Jerusalén. Hicieron cumplir el Islam en esos lugares y trabajaron para erradicar otras religiones dentro de su tierra. Sin embargo, a partir de 1800, el Imperio se volvió más tolerante a la religión, otorgando más derechos a los cristianos y judíos en los Balcanes y Palestina, lo que preservó a una población de judíos y cristianos en el Medio Oriente.
Pero, en general, los otomanos no eran un estado religioso diverso debido a las tierras que conquistó. La mayoría de sus tierras eran musulmanas, por lo que había mucha homogeneidad en términos de religión, incluso si eran culturalmente diversas.