Esta es una muy buena pregunta. Voy a adivinar, ya que dijiste que estás haciendo esta pregunta sinceramente, que las respuestas troll de los ateos simplemente respondieron que Dios no es lo que estabas buscando.
Creo que lo que realmente estás preguntando es teodicea, la cuestión del mal: ¿cómo puede un Dios todo bien permitir el mal en el mundo? Usted observa, con cierta precisión, que la necesidad de que los organismos se consuman entre sí es una especie de maldad. Hay dos respuestas que me gustaría ofrecer.
En primer lugar, desde una perspectiva cristiana, la creación se desvió al principio, y Dios permitió que eso sucediera. Llamemos a esto la respuesta de “libre albedrío”. Esto ofrece una comprensión de los males morales entre las personas, pero parece un poco injusto para, por ejemplo, los gatos cuya biología requiere carne en sus dietas. Eso nos lleva a la segunda parte.
La creación no se crea como “buena” en el sentido en que está usando el término. Esa noción egoísta (incluso si se proyecta el egoísmo, por así decirlo) del bien es bastante moderna. En cambio, la creación se ordena a su propia perfección. Aquí, es necesaria una distinción entre el mal moral y el natural. Eso significa que un animal que se come a otro es bueno (el león sobrevive) con un mal parasitario (la gacela muere). Es cierto que este argumento se vuelve bastante complejo. Aquino escribió todo un tratado sobre él, de malo (sobre el mal).
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Desglosé esto de manera ligeramente diferente en otra respuesta que escribí, así que los invito a mirar allí y ver si ayuda. La respuesta de Joe Fessenden a ¿Cómo puede un cristiano reconciliar a su Dios amoroso con el hecho de que mata a tantas criaturas de manera tan horrible todos los días?
Sigue pensando en esto. Contrariamente a lo que afirman algunos, el cuestionamiento y el pensamiento racional siempre han sido parte del cristianismo. Dios nos dio intelectos para que podamos descubrir los misterios de la creación y, hasta cierto punto, incluso los misterios de Dios mismo.