La lucha por la independencia fue iniciada en gran medida por los musulmanes. En los años 70, la lucha se intensificó después de que los cristianos de las regiones de las tierras altas se unieran al movimiento independiente dominante que estaba dominado por los musulmanes de las regiones de las tierras bajas. Pero la lucha nunca había tenido ningún carácter religioso. Los principales luchadores cristianos quedaron insatisfechos por el carácter de etno-religiosidad del movimiento y formaron otra organización que tiene combatientes cristianos y musulmanes unidos bajo ideologías nacionalistas y marxistas. Esta organización llegó a dominar la lucha eritrea por la independencia y expulsó al antiguo movimiento de Eritrea. Hubo algunas peleas feroces con poca o ninguna influencia religiosa. Finalmente, fue el EPLF el que llevó a Eritrea a su independencia. Aunque el EPLF estaba más dominado por los cristianos, cuenta con el apoyo tanto de los musulmanes de las tierras bajas como de otras partes de la población. La población de Eritrea está igualmente dividida entre las religiones cristiana (Iglesia Ortodoxa, Católica Romana y Luterana) y musulmana. La población de la meseta alta (Asmara) es predominantemente cristiana, mientras que la de las tierras bajas y la costa son predominantemente musulmanas. A pesar de los contrastes entre las religiones musulmana y cristiana y el potencial de conflicto, ambos grupos religiosos han logrado vivir juntos en armonía y en paz.
Iglesia ortodoxa de Enda Mariam Asmara (con la torre
de la catedral católica romana y el minarete de Al Khulafa
Mezquita Al Rashiudin en el fondo)