La afiliación denominacional precisa y los antecedentes religiosos del profesor Xavier no se han descrito claramente. El profesor Xavier se ha referido a Dios muchas veces a lo largo de las décadas durante las cuales el personaje ha existido. El personaje parece tener una creencia vaga o quizás genérica en Dios y en el más allá, pero sus creencias no parecen estar vinculadas a ninguna religión específica. Dado el papel designado por Xavier como inspiración para los mutantes en todas partes, y un faro para la armonía entre mutantes y humanos, parece probable que Xavier sea conscientemente cuidadoso de evitar ser asociado a un sistema de creencias específico, ya que no quiere su ” sueño “de la armonía mutante / humana para parecer una cruzada religiosa sectaria.
Claramente, sin embargo, Charles Xavier es un hombre que tiene creencias y estándares intensamente sentidos. Su deseo de ver que los mutantes y los humanos puedan vivir en paz y armonía ha dominado su vida. La visión de Xavier es tan poderosa que muchos de los mutantes del mundo lo ven como una especie de profeta o líder religioso, tanto en el presente como en el futuro en varios futuros alternativos que los X-Men han vislumbrado de vez en cuando. Bishop, por ejemplo, exhibió un asombro casi religioso de Xavier y los otros X-Men centrales cuando llegó por primera vez al presente desde su futura línea de tiempo. Sin embargo, el propio Xavier nunca ha expresado su mensaje en términos expresamente teológicos ni ha intentado provocar la devoción religiosa hacia sí mismo en un sentido tradicional judeocristiano.