Algunas personas religiosas afirman que existe, pero la única alternativa a la evidencia científica, suponiendo que estemos usando ese término para significar evidencia derivada de la ciencia dura o incluso de la ciencia social, es la evidencia histórica.
Se requieren dos tipos de evidencia histórica para probar que algo sucedió. Uno puede ser más fuerte que el otro, pero ambos deben estar presentes. Son evidencia primaria y evidencia secundaria.
La evidencia histórica primaria se presenta en forma de documentos, cuentas arqueológicas, paleontológicas o de testigos oculares. Los primeros tres se explican por sí mismos siempre y cuando uno no malinterprete lo que indican. Por ejemplo, toda la evidencia arqueológica de la religión egipcia no prueba que los dioses egipcios existen (ed), pero juzga que los egipcios creían que sí.
Las cuentas de los testigos oculares deben ser de personas que realmente estuvieron en el evento y su utilidad se deteriora rápidamente con el tiempo transcurrido desde el supuesto evento hasta que se registra la cuenta del testigo ocular. Los Evangelios, por ejemplo, fracasan como evidencia principal porque el primero se escribió unos 60 años después de que se suponía que los eventos tuvieron lugar y la mayoría fueron esfuerzos de colaboración o escritos por personas que no estaban allí.
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La evidencia secundaria es información sobre eventos que rodean el evento que uno está tratando de probar, pero no está directamente conectado. Por ejemplo, el relato evangélico de Jesús entrando en Jerusalén con multitudes de personas animándolo y arrojando hojas de palma frente a él no es compatible con lo que sabemos de la ocupación romana de Medio Oriente: no habrían tolerado tal manifestación e incluso si fuera así. Si hubiera sucedido, tenían muchos informadores en la población, por lo que no habrían tenido que pagarle a Judas 30 monedas de plata para traicionarlo.
Problemas similares surgen con cualquier evidencia de conversaciones entre Moisés y Mahoma y Dios, sin testigos oculares, sin evidencia secundaria de apoyo. Otras religiones, no abrahámicas, se encuentran con el mismo problema.