Hay grandes diferencias en la interpretación. Lo más notable es el desacuerdo entre chiítas y sunitas.
Después de la muerte del profeta Mahoma en 632, surgió una disputa sobre quién debería cuidar la nueva fe.
Algunos creían que un nuevo líder debería ser elegido por consenso; otros pensaban que solo los descendientes del profeta deberían convertirse en califa. El título pasó a un asistente de confianza, Abu Bakr.
Algunos (que ahora son chiítas) pensaron que debería haber ido a Ali, el primo y yerno del profeta. Ali finalmente se convirtió en califa después de que los dos sucesores de Abu Bakr fueran asesinados.
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Sin embargo, incluso dentro de la rama mucho más grande del Islam sunita, las divisiones entre diferentes sectas son enormes. En el Reino Unido, las dos sectas más grandes del Islam son Deobandi y Barelvi. Ambos son sunitas, pero se consideran herejes debido a las diferencias de creencias. Deobandi se considera más fanático y ‘puritano’ si lo desea (muy similar al salafismo y la razón principal por la que muchos británicos resienten la presencia del Islam en su país).
Los Barelvi tienen más en común con las prácticas sufíes, como la veneración de los santos, sin embargo, comparten algunas similitudes con los Deobandi, incluso si ninguna de las sectas quiere reconocer esto.
También hay sectas más pequeñas como la Ahmaddiyah que predican la tolerancia y el amor por todas las religiones / culturas. Son una de las sectas del Islam de más rápido crecimiento en el mundo y han establecido presencia en muchos países africanos. Fue fundada por un hombre llamado Mirza Ghulam Ahmad en 1889. Ahmad afirmó que era el esperado Mesías y Mahdi profetizado por el Profeta Muhammad y predicho por el Sagrado Corán. La mayoría de los musulmanes los consideran herejes.